Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms