Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RPS29P62273 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RPS29P62273 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RPS29P62273 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RPS29P62273 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RPS29P62273 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms