Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms