Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HOXA13P31271 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HOXA13P31271 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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