Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD1P28340 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLD1P28340 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms