Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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