Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDSP20132 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDSP20132 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms