Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP2C9P11712 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms