Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
APELAP0DMC3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
APELAP0DMC3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
APELAP0DMC3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
APELAP0DMC3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
APELAP0DMC3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
APELAP0DMC3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
APELAP0DMC3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
APELAP0DMC3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
APELAP0DMC3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
APELAP0DMC3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms