Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms