Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F9P00740 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F9P00740 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms