Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24AO95486 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms