Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms