Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 SETD7-201ENST00000274031 7365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 GAA-202ENST00000390015 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 UTP3-201ENST00000254803 2073 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ANKUB1-202ENST00000462519 2222 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ETFDH-206ENST00000511912 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 IKZF4-202ENST00000431367 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 KLK2-203ENST00000391810 2674 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 KRT38-201ENST00000246646 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 AL117378.1-201ENST00000454596 2305 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 TSPAN2-202ENST00000369516 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 LINC01070-201ENST00000561786 2829 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 AL022318.4-201ENST00000381568 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 SLC18A1-205ENST00000440926 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 HKR1-204ENST00000544914 2854 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 AIPL1-203ENST00000381129 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 AL359317.2-201ENST00000554898 1826 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 TRMT10B-201ENST00000297994 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 AC107892.1-201ENST00000577382 2727 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ASIC2-202ENST00000359872 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 TRMT12-201ENST00000328599 2207 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 MPP2-201ENST00000269095 4414 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CCDC179H3BU77 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms