Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms