Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms