Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms