Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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