Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWA8A3KMH1 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms