Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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