Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms