Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms