Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DBF4Q9UBU7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DBF4Q9UBU7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DBF4Q9UBU7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DBF4Q9UBU7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DBF4Q9UBU7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DBF4Q9UBU7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms