Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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