Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
REREQ9P2R6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REREQ9P2R6 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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