Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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HOXC10Q9NYD6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXC10Q9NYD6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXC10Q9NYD6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXC10Q9NYD6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXC10Q9NYD6 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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HOXC10Q9NYD6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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