Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM248Q9NWD8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms