Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms