Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMILIN3Q9NT22 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms