Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms