Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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UBQLN4Q9NRR5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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UBQLN4Q9NRR5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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UBQLN4Q9NRR5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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UBQLN4Q9NRR5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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