Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNPLA8Q9NP80 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNPLA8Q9NP80 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNPLA8Q9NP80 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNPLA8Q9NP80 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNPLA8Q9NP80 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNPLA8Q9NP80 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNPLA8Q9NP80 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PNPLA8Q9NP80 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms