Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LINC00597Q9H2U6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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LINC00597Q9H2U6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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LINC00597Q9H2U6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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