Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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