Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms