Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms