Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms