Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms