Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SYT17Q9BSW7 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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