Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 ZNF827-201ENST00000379448 4197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SIGMAR1Q99720 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SIGMAR1Q99720 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 SPATA31C1-202ENST00000602681 1927 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SIGMAR1Q99720 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SIGMAR1Q99720 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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SIGMAR1Q99720 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 AC021517.1-202ENST00000585897 2111 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 ARSJ-201ENST00000315366 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SIGMAR1Q99720 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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