Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SAMD8Q96LT4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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