Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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