Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms