Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO3Q8TAP4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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