Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms