Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms