Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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