Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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TRAPPC6BQ86SZ2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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