Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms