Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TCF23Q7RTU1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TCF23Q7RTU1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms